Marți, 8 iulie 2014.- O echipă de cercetători de la Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR) a participat la o anchetă internațională care a identificat 518 noi microbacterii, complet necunoscute până acum, în microbiota umană (flora intestinală).
Cercetarea, în care oamenii de știință au utilizat o nouă abordare a analizei bioinformatice, a extins și catalogul genelor microbiene cunoscute, de la 3 la 10 milioane.
Rezultatele acestei cercetări, publicată duminică de revista Nature Biotechnology, fac parte din proiectul european MetaHIT (Metagenomics Human Intestinal Tract), dotat cu 11, 4 milioane de euro pentru a investiga modul în care microbiomul uman se raportează la sănătate și boli. . Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) este unul dintre cei 13 participanți la acest proiect - și singurul centru spaniol - sub conducerea Dr. Francisco Guarner, care a explicat că nu toate probele studiate nu au acest lucru numărul de specii necunoscute.
Probele din flora intestinală a unor indivizi au foarte puține dintre aceste specii și, atunci când au fost analizate în detaliu, au văzut că sunt mostre de pacienți cu boala Crohn. "Acest lucru sugerează că aceste specii, până acum necunoscute, sunt posibil cele care fac diferența între microbiota oamenilor sănătoși și cea a bolnavilor", a anunțat Guarner.
Potrivit cercetătorului, aceste date deschid strategii pentru a încerca să recupereze aceste specii cu intervenții nutriționale: administrarea fibrelor, prebiotice care ajută la creșterea selectivă a unor specii sau probiotice.
Aceste bacterii necunoscute sunt probabil din așa-numitele „bacterii bune”, deoarece nu sunt cele tipice care provoacă o infecție și nici nu sunt cunoscute sau izolate înainte. Potrivit Guarner, bacteriile descoperite nu pot fi izolate, deoarece „aproape sigur că nu vor supraviețui în afara colonului pentru a fi transplantate”.
Responsabilul lucrării și cercetătorul Grupului VHIR de Fiziologie și Fiziopatologie Digestivă a indicat că noile specii descoperite „nu sunt cultivabile, sunt foarte sensibile la oxigen, adică sunt anaerobe foarte stricte și stabilesc o mare dependență de mediul lor pentru a putea supraviețuiește ”. "Din același motiv, când am mers la bazele de date nu am găsit nicio urmă și până acum nu știam nimic despre ele", a spus Guarner.
Descoperirea a fost posibilă datorită unei noi abordări a analizei bioinformatice care a permis acestor specii să „iasă” la suprafață.
"În prezent - potrivit Guarner -, doar 10% din materialul genetic secvențiat este cunoscut cu o fiabilitate de 95%. Acest lucru lasă o zonă cenușie uriașă care este lucrată în prezent."
Studiul a detectat 741 de specii metagenomice diferite, numite pentru imposibilitatea de a le atribui un nume. În contrast cu bazele de date, cercetătorii au văzut că 115 dintre aceste specii erau deja cunoscute, în timp ce 518 sunt necunoscute; restul de 108 sunt parțial cunoscute.
„Acum știm cum arată genomul acestor specii metagenomice, dar nu numele și prenumele lor”, a explicat Guarner.
Există un număr mic a cărui specie nu este cunoscută, dar sexul sau familia din care fac parte și aproximativ 200 de specii metagenomice din cele descrise nu pot fi clasificate în niciun fel, deoarece mai mult de 80% din genele lor sunt total necunoscute astăzi.
Potrivit oamenilor de știință, microorganismele care trăiesc la om sunt de aproximativ 100 de miliarde, de 10 ori mai mult decât numărul total de celule umane.
Rezultatele inițiale ale aceluiași proiect, în 2010, au indicat 3.300.000 de gene diferite, traduse în 20.000 de funcții diferite, dintre care 5.000 necunoscute până acum.
Fiecare persoană are aproximativ 600.000 din aceste gene microbiene și 300.000 sunt repetate constant în rândul tuturor indivizilor. In acest nou studiu, numarul este inmultit cu trei si 9.879.896 gene diferite sunt atinse, a spus Guarner.
Tag-Uri:
Cut-And-Copil Glosar Sex
Cercetarea, în care oamenii de știință au utilizat o nouă abordare a analizei bioinformatice, a extins și catalogul genelor microbiene cunoscute, de la 3 la 10 milioane.
Rezultatele acestei cercetări, publicată duminică de revista Nature Biotechnology, fac parte din proiectul european MetaHIT (Metagenomics Human Intestinal Tract), dotat cu 11, 4 milioane de euro pentru a investiga modul în care microbiomul uman se raportează la sănătate și boli. . Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) este unul dintre cei 13 participanți la acest proiect - și singurul centru spaniol - sub conducerea Dr. Francisco Guarner, care a explicat că nu toate probele studiate nu au acest lucru numărul de specii necunoscute.
Probele din flora intestinală a unor indivizi au foarte puține dintre aceste specii și, atunci când au fost analizate în detaliu, au văzut că sunt mostre de pacienți cu boala Crohn. "Acest lucru sugerează că aceste specii, până acum necunoscute, sunt posibil cele care fac diferența între microbiota oamenilor sănătoși și cea a bolnavilor", a anunțat Guarner.
"Bacterii bune"
Potrivit cercetătorului, aceste date deschid strategii pentru a încerca să recupereze aceste specii cu intervenții nutriționale: administrarea fibrelor, prebiotice care ajută la creșterea selectivă a unor specii sau probiotice.
Aceste bacterii necunoscute sunt probabil din așa-numitele „bacterii bune”, deoarece nu sunt cele tipice care provoacă o infecție și nici nu sunt cunoscute sau izolate înainte. Potrivit Guarner, bacteriile descoperite nu pot fi izolate, deoarece „aproape sigur că nu vor supraviețui în afara colonului pentru a fi transplantate”.
Responsabilul lucrării și cercetătorul Grupului VHIR de Fiziologie și Fiziopatologie Digestivă a indicat că noile specii descoperite „nu sunt cultivabile, sunt foarte sensibile la oxigen, adică sunt anaerobe foarte stricte și stabilesc o mare dependență de mediul lor pentru a putea supraviețuiește ”. "Din același motiv, când am mers la bazele de date nu am găsit nicio urmă și până acum nu știam nimic despre ele", a spus Guarner.
Diferite specii metagenomice
Descoperirea a fost posibilă datorită unei noi abordări a analizei bioinformatice care a permis acestor specii să „iasă” la suprafață.
"În prezent - potrivit Guarner -, doar 10% din materialul genetic secvențiat este cunoscut cu o fiabilitate de 95%. Acest lucru lasă o zonă cenușie uriașă care este lucrată în prezent."
Studiul a detectat 741 de specii metagenomice diferite, numite pentru imposibilitatea de a le atribui un nume. În contrast cu bazele de date, cercetătorii au văzut că 115 dintre aceste specii erau deja cunoscute, în timp ce 518 sunt necunoscute; restul de 108 sunt parțial cunoscute.
„Acum știm cum arată genomul acestor specii metagenomice, dar nu numele și prenumele lor”, a explicat Guarner.
Există un număr mic a cărui specie nu este cunoscută, dar sexul sau familia din care fac parte și aproximativ 200 de specii metagenomice din cele descrise nu pot fi clasificate în niciun fel, deoarece mai mult de 80% din genele lor sunt total necunoscute astăzi.
O persoană are 600.000 de gene microbiene
Potrivit oamenilor de știință, microorganismele care trăiesc la om sunt de aproximativ 100 de miliarde, de 10 ori mai mult decât numărul total de celule umane.
Rezultatele inițiale ale aceluiași proiect, în 2010, au indicat 3.300.000 de gene diferite, traduse în 20.000 de funcții diferite, dintre care 5.000 necunoscute până acum.
Fiecare persoană are aproximativ 600.000 din aceste gene microbiene și 300.000 sunt repetate constant în rândul tuturor indivizilor. In acest nou studiu, numarul este inmultit cu trei si 9.879.896 gene diferite sunt atinse, a spus Guarner.
--zwyke-lenistwo-czy-choroba-cywilizacyjna.jpg)
